Protein–RNA interactions for Protein: P43308

SSR2, Translocon-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR2P43308 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSR2P43308 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR2P43308 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR2P43308 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR2P43308 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR2P43308 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR2P43308 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSR2P43308 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR2P43308 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR2P43308 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR2P43308 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR2P43308 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR2P43308 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR2P43308 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSR2P43308 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR2P43308 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR2P43308 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR2P43308 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR2P43308 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR2P43308 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR2P43308 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSR2P43308 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSR2P43308 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR2P43308 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR2P43308 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR2P43308 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR2P43308 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR2P43308 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR2P43308 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR2P43308 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR2P43308 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR2P43308 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SSR2P43308 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR2P43308 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR2P43308 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR2P43308 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR2P43308 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR2P43308 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSR2P43308 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR2P43308 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR2P43308 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR2P43308 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR2P43308 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSR2P43308 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR2P43308 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR2P43308 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR2P43308 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSR2P43308 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR2P43308 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR2P43308 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR2P43308 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR2P43308 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR2P43308 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR2P43308 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR2P43308 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR2P43308 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR2P43308 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSR2P43308 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSR2P43308 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR2P43308 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR2P43308 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR2P43308 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR2P43308 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR2P43308 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR2P43308 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSR2P43308 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR2P43308 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR2P43308 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR2P43308 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR2P43308 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR2P43308 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms