Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRATP43155 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRATP43155 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRATP43155 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRATP43155 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRATP43155 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRATP43155 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRATP43155 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRATP43155 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRATP43155 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRATP43155 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CRATP43155 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRATP43155 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRATP43155 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRATP43155 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRATP43155 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRATP43155 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRATP43155 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRATP43155 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRATP43155 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRATP43155 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRATP43155 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRATP43155 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRATP43155 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRATP43155 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRATP43155 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRATP43155 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRATP43155 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CRATP43155 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRATP43155 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRATP43155 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRATP43155 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRATP43155 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRATP43155 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRATP43155 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRATP43155 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRATP43155 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRATP43155 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRATP43155 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRATP43155 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRATP43155 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CRATP43155 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRATP43155 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRATP43155 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRATP43155 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRATP43155 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRATP43155 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRATP43155 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRATP43155 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRATP43155 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRATP43155 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRATP43155 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRATP43155 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRATP43155 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRATP43155 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRATP43155 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRATP43155 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRATP43155 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRATP43155 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRATP43155 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRATP43155 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRATP43155 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRATP43155 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRATP43155 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRATP43155 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRATP43155 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRATP43155 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRATP43155 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRATP43155 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRATP43155 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRATP43155 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRATP43155 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRATP43155 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRATP43155 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRATP43155 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRATP43155 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRATP43155 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CRATP43155 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRATP43155 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRATP43155 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRATP43155 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRATP43155 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRATP43155 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRATP43155 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRATP43155 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRATP43155 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRATP43155 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRATP43155 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRATP43155 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRATP43155 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRATP43155 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRATP43155 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRATP43155 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRATP43155 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRATP43155 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRATP43155 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRATP43155 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRATP43155 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRATP43155 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRATP43155 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms