Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTGFRP43088 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTGFRP43088 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGFRP43088 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms