Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIK3CAP42336 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIK3CAP42336 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PIK3CAP42336 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3CAP42336 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms