Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIA2P42262 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms