Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSKP41240 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSKP41240 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSKP41240 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSKP41240 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSKP41240 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSKP41240 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSKP41240 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSKP41240 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSKP41240 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSKP41240 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSKP41240 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSKP41240 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSKP41240 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSKP41240 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSKP41240 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSKP41240 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSKP41240 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSKP41240 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSKP41240 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSKP41240 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSKP41240 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSKP41240 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSKP41240 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSKP41240 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSKP41240 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSKP41240 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSKP41240 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSKP41240 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CSKP41240 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSKP41240 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSKP41240 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSKP41240 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSKP41240 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSKP41240 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CSKP41240 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSKP41240 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSKP41240 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSKP41240 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSKP41240 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSKP41240 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSKP41240 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSKP41240 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSKP41240 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSKP41240 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CSKP41240 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSKP41240 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSKP41240 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSKP41240 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSKP41240 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSKP41240 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSKP41240 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSKP41240 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSKP41240 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSKP41240 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSKP41240 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSKP41240 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSKP41240 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSKP41240 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSKP41240 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSKP41240 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSKP41240 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSKP41240 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSKP41240 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSKP41240 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CSKP41240 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSKP41240 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSKP41240 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSKP41240 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSKP41240 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSKP41240 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSKP41240 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSKP41240 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSKP41240 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSKP41240 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSKP41240 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSKP41240 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSKP41240 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSKP41240 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSKP41240 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSKP41240 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSKP41240 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSKP41240 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSKP41240 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSKP41240 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSKP41240 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSKP41240 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSKP41240 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSKP41240 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSKP41240 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSKP41240 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSKP41240 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSKP41240 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSKP41240 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSKP41240 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSKP41240 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSKP41240 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSKP41240 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSKP41240 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSKP41240 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms