Protein–RNA interactions for Protein: P40926

MDH2, Malate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH2P40926 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH2P40926 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH2P40926 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH2P40926 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH2P40926 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MDH2P40926 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
MDH2P40926 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDH2P40926 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDH2P40926 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDH2P40926 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDH2P40926 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDH2P40926 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDH2P40926 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDH2P40926 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDH2P40926 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDH2P40926 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MDH2P40926 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDH2P40926 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MDH2P40926 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDH2P40926 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MDH2P40926 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MDH2P40926 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDH2P40926 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDH2P40926 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDH2P40926 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDH2P40926 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDH2P40926 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDH2P40926 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDH2P40926 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDH2P40926 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MDH2P40926 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDH2P40926 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDH2P40926 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MDH2P40926 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH2P40926 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH2P40926 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH2P40926 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH2P40926 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH2P40926 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH2P40926 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH2P40926 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH2P40926 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MDH2P40926 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH2P40926 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH2P40926 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH2P40926 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH2P40926 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH2P40926 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH2P40926 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MDH2P40926 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH2P40926 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH2P40926 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH2P40926 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH2P40926 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH2P40926 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MDH2P40926 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH2P40926 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH2P40926 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH2P40926 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH2P40926 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH2P40926 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH2P40926 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH2P40926 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH2P40926 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MDH2P40926 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH2P40926 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH2P40926 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH2P40926 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH2P40926 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH2P40926 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH2P40926 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH2P40926 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH2P40926 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH2P40926 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MDH2P40926 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH2P40926 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH2P40926 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH2P40926 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH2P40926 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH2P40926 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MDH2P40926 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH2P40926 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH2P40926 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH2P40926 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH2P40926 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MDH2P40926 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms