Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 CRF1YDR223W 1404 nt5.45□□□□□ -1.54
DDI1P40087 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt5.44□□□□□ -1.54
DDI1P40087 SCS7YMR272C 1155 nt5.44□□□□□ -1.54
DDI1P40087 YBR027CYBR027C 333 nt5.44□□□□□ -1.54
DDI1P40087 RDL2YOR286W 450 nt5.44□□□□□ -1.54
DDI1P40087 YTH1YPR107C 627 nt5.44□□□□□ -1.54
DDI1P40087 SGF29YCL010C 780 nt5.44□□□□□ -1.54
DDI1P40087 YME1YPR024W 2244 nt5.43□□□□□ -1.54
DDI1P40087 UBX2YML013W 1755 nt5.43□□□□□ -1.54
DDI1P40087 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.42□□□□□ -1.54
DDI1P40087 MNN2YBR015C 1794 nt5.42□□□□□ -1.54
DDI1P40087 ERG7YHR072W 2196 nt5.42□□□□□ -1.54
DDI1P40087 VCX1YDL128W 1236 nt5.42□□□□□ -1.54
DDI1P40087 TRP1YDR007W 675 nt5.42□□□□□ -1.54
DDI1P40087 KSS1YGR040W 1107 nt5.42□□□□□ -1.54
DDI1P40087 TIF2YJL138C 1188 nt5.42□□□□□ -1.54
DDI1P40087 TIF1YKR059W 1188 nt5.42□□□□□ -1.54
DDI1P40087 RHO2YNL090W 579 nt5.42□□□□□ -1.54
DDI1P40087 SMF2YHR050W 1650 nt5.42□□□□□ -1.54
DDI1P40087 DBF4YDR052C 2115 nt5.42□□□□□ -1.54
DDI1P40087 CLP1YOR250C 1338 nt5.42□□□□□ -1.54
DDI1P40087 YMR027WYMR027W 1413 nt5.41□□□□□ -1.54
DDI1P40087 RVB2YPL235W 1416 nt5.41□□□□□ -1.54
DDI1P40087 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.41□□□□□ -1.54
DDI1P40087 YPL136WYPL136W 369 nt5.41□□□□□ -1.54
DDI1P40087 SUE1YPR151C 621 nt5.41□□□□□ -1.54
DDI1P40087 GUP2YPL189W 1830 nt5.41□□□□□ -1.54
DDI1P40087 RET1YOR207C 3450 nt5.4□□□□□ -1.54
DDI1P40087 VTH1YIL173W 4650 nt5.4□□□□□ -1.54
DDI1P40087 VTH2YJL222W 4650 nt5.4□□□□□ -1.54
DDI1P40087 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.4□□□□□ -1.54
DDI1P40087 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.4□□□□□ -1.54
DDI1P40087 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.4□□□□□ -1.54
DDI1P40087 STM1YLR150W 822 nt5.4□□□□□ -1.54
DDI1P40087 RRT2YBR246W 1164 nt5.4□□□□□ -1.54
DDI1P40087 CHL4YDR254W 1377 nt5.4□□□□□ -1.55
DDI1P40087 QDR3YBR043C 2070 nt5.39□□□□□ -1.55
DDI1P40087 DEF1YKL054C 2217 nt5.39□□□□□ -1.55
DDI1P40087 YET3YDL072C 612 nt5.39□□□□□ -1.55
DDI1P40087 HEM3YDL205C 984 nt5.39□□□□□ -1.55
DDI1P40087 DJP1YIR004W 1299 nt5.39□□□□□ -1.55
DDI1P40087 SFC1YJR095W 969 nt5.39□□□□□ -1.55
DDI1P40087 PSH1YOL054W 1221 nt5.39□□□□□ -1.55
DDI1P40087 ASH1YKL185W 1767 nt5.39□□□□□ -1.55
DDI1P40087 GIT1YCR098C 1557 nt5.38□□□□□ -1.55
DDI1P40087 YJL171CYJL171C 1191 nt5.38□□□□□ -1.55
DDI1P40087 HOR7YMR251W-A 180 nt5.38□□□□□ -1.55
DDI1P40087 GFD1YMR255W 567 nt5.38□□□□□ -1.55
DDI1P40087 OST3YOR085W 1053 nt5.38□□□□□ -1.55
DDI1P40087 snR32snR32 188 nt5.38□□□□□ -1.55
DDI1P40087 ILV6YCL009C 930 nt5.38□□□□□ -1.55
DDI1P40087 VNX1YNL321W 2727 nt5.38□□□□□ -1.55
DDI1P40087 YNL095CYNL095C 1929 nt5.37□□□□□ -1.55
DDI1P40087 GYP1YOR070C 1914 nt5.37□□□□□ -1.55
DDI1P40087 IMG1YCR046C 510 nt5.37□□□□□ -1.55
DDI1P40087 YDR401WYDR401W 564 nt5.37□□□□□ -1.55
DDI1P40087 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.37□□□□□ -1.55
DDI1P40087 BUD32YGR262C 786 nt5.37□□□□□ -1.55
DDI1P40087 MPC2YHR162W 390 nt5.37□□□□□ -1.55
DDI1P40087 ASN1YPR145W 1719 nt5.37□□□□□ -1.55
DDI1P40087 MAK31YCR020C-A 267 nt5.36□□□□□ -1.55
DDI1P40087 SNZ3YFL059W 897 nt5.36□□□□□ -1.55
DDI1P40087 PHB1YGR132C 864 nt5.36□□□□□ -1.55
DDI1P40087 LYS12YIL094C 1116 nt5.36□□□□□ -1.55
DDI1P40087 ASK1YKL052C 879 nt5.36□□□□□ -1.55
DDI1P40087 SNZ2YNL333W 897 nt5.36□□□□□ -1.55
DDI1P40087 ICL1YER065C 1674 nt5.36□□□□□ -1.55
DDI1P40087 RFA1YAR007C 1866 nt5.36□□□□□ -1.55
DDI1P40087 RAD24YER173W 1980 nt5.36□□□□□ -1.55
DDI1P40087 SSK1YLR006C 2139 nt5.36□□□□□ -1.55
DDI1P40087 VRP1YLR337C 2454 nt5.35□□□□□ -1.55
DDI1P40087 CUP2YGL166W 678 nt5.35□□□□□ -1.55
DDI1P40087 MED6YHR058C 888 nt5.35□□□□□ -1.55
DDI1P40087 AIM20YIL158W 615 nt5.35□□□□□ -1.55
DDI1P40087 HPF1YOL155C 2904 nt5.35□□□□□ -1.55
DDI1P40087 ACS2YLR153C 2052 nt5.35□□□□□ -1.55
DDI1P40087 PWP1YLR196W 1731 nt5.34□□□□□ -1.55
DDI1P40087 ENP1YBR247C 1452 nt5.34□□□□□ -1.55
DDI1P40087 UGX2YDL169C 672 nt5.34□□□□□ -1.55
DDI1P40087 YDL218WYDL218W 954 nt5.34□□□□□ -1.55
DDI1P40087 YDR053WYDR053W 396 nt5.34□□□□□ -1.55
DDI1P40087 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.34□□□□□ -1.55
DDI1P40087 POR2YIL114C 846 nt5.34□□□□□ -1.55
DDI1P40087 CAF40YNL288W 1122 nt5.34□□□□□ -1.55
DDI1P40087 CAM1YPL048W 1248 nt5.34□□□□□ -1.55
DDI1P40087 RBD2YPL246C 789 nt5.34□□□□□ -1.55
DDI1P40087 RPO26YPR187W 468 nt5.34□□□□□ -1.55
DDI1P40087 TAE1YBR261C 699 nt5.34□□□□□ -1.55
DDI1P40087 OCA5YHL029C 2040 nt5.34□□□□□ -1.55
DDI1P40087 ASF2YDL197C 1578 nt5.33□□□□□ -1.56
DDI1P40087 SIP5YMR140W 1470 nt5.33□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YPR196WYPR196W 1413 nt5.33□□□□□ -1.56
DDI1P40087 ACC1YNR016C 6702 nt5.33□□□□□ -1.56
DDI1P40087 ABZ1YNR033W 2364 nt5.33□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YGL072CYGL072C 360 nt5.33□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YIL060WYIL060W 435 nt5.33□□□□□ -1.56
DDI1P40087 PUS5YLR165C 765 nt5.33□□□□□ -1.56
DDI1P40087 EXO1YOR033C 2109 nt5.33□□□□□ -1.56
DDI1P40087 AAP1YHR047C 2571 nt5.33□□□□□ -1.56
DDI1P40087 EIS1YMR031C 2532 nt5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms