Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC1P35052 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC1P35052 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC1P35052 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC1P35052 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC1P35052 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPC1P35052 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC1P35052 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC1P35052 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC1P35052 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPC1P35052 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC1P35052 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC1P35052 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC1P35052 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC1P35052 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC1P35052 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GPC1P35052 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GPC1P35052 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC1P35052 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC1P35052 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GPC1P35052 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC1P35052 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC1P35052 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC1P35052 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC1P35052 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC1P35052 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC1P35052 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC1P35052 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPC1P35052 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC1P35052 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC1P35052 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC1P35052 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC1P35052 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC1P35052 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPC1P35052 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC1P35052 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC1P35052 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC1P35052 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPC1P35052 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC1P35052 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC1P35052 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC1P35052 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC1P35052 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC1P35052 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC1P35052 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPC1P35052 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPC1P35052 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC1P35052 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC1P35052 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC1P35052 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPC1P35052 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GPC1P35052 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC1P35052 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC1P35052 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC1P35052 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC1P35052 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC1P35052 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPC1P35052 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC1P35052 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC1P35052 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC1P35052 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC1P35052 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPC1P35052 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC1P35052 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC1P35052 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC1P35052 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC1P35052 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC1P35052 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC1P35052 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC1P35052 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC1P35052 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPC1P35052 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC1P35052 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC1P35052 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC1P35052 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC1P35052 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC1P35052 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC1P35052 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC1P35052 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC1P35052 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC1P35052 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPC1P35052 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC1P35052 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC1P35052 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPC1P35052 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms