Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM4P33991 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM4P33991 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM4P33991 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM4P33991 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MCM4P33991 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM4P33991 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM4P33991 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MCM4P33991 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM4P33991 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM4P33991 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM4P33991 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM4P33991 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM4P33991 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM4P33991 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MCM4P33991 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCM4P33991 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MCM4P33991 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
MCM4P33991 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MCM4P33991 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MCM4P33991 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM4P33991 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM4P33991 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM4P33991 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM4P33991 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MCM4P33991 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM4P33991 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM4P33991 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM4P33991 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM4P33991 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM4P33991 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM4P33991 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM4P33991 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM4P33991 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM4P33991 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM4P33991 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM4P33991 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MCM4P33991 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM4P33991 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM4P33991 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM4P33991 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM4P33991 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM4P33991 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM4P33991 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM4P33991 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM4P33991 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM4P33991 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM4P33991 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM4P33991 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM4P33991 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM4P33991 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MCM4P33991 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM4P33991 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM4P33991 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM4P33991 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM4P33991 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM4P33991 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM4P33991 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM4P33991 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM4P33991 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MCM4P33991 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM4P33991 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM4P33991 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM4P33991 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM4P33991 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM4P33991 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM4P33991 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM4P33991 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MCM4P33991 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM4P33991 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM4P33991 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM4P33991 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MCM4P33991 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM4P33991 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM4P33991 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM4P33991 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MCM4P33991 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM4P33991 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM4P33991 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM4P33991 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM4P33991 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MCM4P33991 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM4P33991 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM4P33991 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM4P33991 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM4P33991 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM4P33991 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM4P33991 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM4P33991 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM4P33991 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM4P33991 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM4P33991 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM4P33991 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MCM4P33991 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM4P33991 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM4P33991 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM4P33991 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM4P33991 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM4P33991 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MCM4P33991 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms