Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH5P33151 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH5P33151 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH5P33151 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH5P33151 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH5P33151 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH5P33151 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH5P33151 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH5P33151 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH5P33151 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH5P33151 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH5P33151 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH5P33151 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH5P33151 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH5P33151 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH5P33151 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH5P33151 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH5P33151 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH5P33151 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH5P33151 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH5P33151 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH5P33151 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH5P33151 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH5P33151 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH5P33151 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDH5P33151 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH5P33151 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH5P33151 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH5P33151 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH5P33151 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH5P33151 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH5P33151 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH5P33151 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH5P33151 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH5P33151 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH5P33151 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH5P33151 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH5P33151 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH5P33151 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH5P33151 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH5P33151 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH5P33151 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH5P33151 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH5P33151 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH5P33151 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH5P33151 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH5P33151 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH5P33151 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH5P33151 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH5P33151 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH5P33151 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH5P33151 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH5P33151 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH5P33151 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH5P33151 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH5P33151 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH5P33151 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH5P33151 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH5P33151 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH5P33151 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH5P33151 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH5P33151 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH5P33151 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH5P33151 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH5P33151 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH5P33151 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH5P33151 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH5P33151 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH5P33151 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH5P33151 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH5P33151 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH5P33151 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH5P33151 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH5P33151 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH5P33151 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH5P33151 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDH5P33151 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDH5P33151 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH5P33151 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH5P33151 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH5P33151 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH5P33151 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH5P33151 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH5P33151 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH5P33151 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH5P33151 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH5P33151 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH5P33151 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH5P33151 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH5P33151 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH5P33151 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH5P33151 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH5P33151 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH5P33151 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH5P33151 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH5P33151 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH5P33151 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH5P33151 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH5P33151 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDH5P33151 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms