Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP1P32455 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP1P32455 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP1P32455 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP1P32455 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP1P32455 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP1P32455 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP1P32455 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP1P32455 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP1P32455 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP1P32455 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP1P32455 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP1P32455 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP1P32455 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP1P32455 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP1P32455 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP1P32455 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP1P32455 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP1P32455 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP1P32455 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP1P32455 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP1P32455 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP1P32455 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP1P32455 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP1P32455 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP1P32455 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP1P32455 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP1P32455 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP1P32455 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP1P32455 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP1P32455 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP1P32455 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP1P32455 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP1P32455 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP1P32455 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP1P32455 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP1P32455 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP1P32455 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP1P32455 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GBP1P32455 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP1P32455 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP1P32455 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP1P32455 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP1P32455 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP1P32455 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GBP1P32455 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP1P32455 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP1P32455 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP1P32455 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP1P32455 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP1P32455 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP1P32455 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP1P32455 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP1P32455 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP1P32455 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP1P32455 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GBP1P32455 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP1P32455 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP1P32455 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP1P32455 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP1P32455 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP1P32455 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP1P32455 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GBP1P32455 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP1P32455 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP1P32455 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP1P32455 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP1P32455 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP1P32455 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP1P32455 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP1P32455 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GBP1P32455 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP1P32455 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP1P32455 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP1P32455 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP1P32455 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP1P32455 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GBP1P32455 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP1P32455 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP1P32455 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP1P32455 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP1P32455 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GBP1P32455 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP1P32455 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP1P32455 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP1P32455 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GBP1P32455 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP1P32455 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP1P32455 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP1P32455 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP1P32455 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP1P32455 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GBP1P32455 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP1P32455 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GBP1P32455 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP1P32455 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP1P32455 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GBP1P32455 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP1P32455 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP1P32455 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms