Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHRNA3P32297 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNA3P32297 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNA3P32297 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms