Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
L1CAMP32004 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
L1CAMP32004 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
L1CAMP32004 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms