Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSPOP30536 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSPOP30536 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSPOP30536 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSPOP30536 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSPOP30536 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSPOP30536 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSPOP30536 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSPOP30536 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSPOP30536 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TSPOP30536 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSPOP30536 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSPOP30536 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TSPOP30536 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSPOP30536 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSPOP30536 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSPOP30536 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSPOP30536 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSPOP30536 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSPOP30536 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSPOP30536 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TSPOP30536 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPOP30536 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPOP30536 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPOP30536 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPOP30536 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPOP30536 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPOP30536 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPOP30536 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPOP30536 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPOP30536 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPOP30536 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPOP30536 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPOP30536 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPOP30536 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TSPOP30536 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TSPOP30536 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSPOP30536 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSPOP30536 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSPOP30536 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSPOP30536 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSPOP30536 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TSPOP30536 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TSPOP30536 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSPOP30536 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSPOP30536 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSPOP30536 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSPOP30536 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSPOP30536 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSPOP30536 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSPOP30536 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TSPOP30536 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSPOP30536 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSPOP30536 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TSPOP30536 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TSPOP30536 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSPOP30536 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSPOP30536 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSPOP30536 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSPOP30536 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TSPOP30536 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSPOP30536 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSPOP30536 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TSPOP30536 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSPOP30536 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSPOP30536 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSPOP30536 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSPOP30536 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSPOP30536 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TSPOP30536 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms