Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LMOD1P29536 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMOD1P29536 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMOD1P29536 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMOD1P29536 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms