Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM5AP29375 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
KDM5AP29375 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
KDM5AP29375 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDM5AP29375 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDM5AP29375 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms