Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HTR2AP28223 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HTR2AP28223 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HTR2AP28223 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HTR2AP28223 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms