Protein–RNA interactions for Protein: P27482

CALML3, Calmodulin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML3P27482 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALML3P27482 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CALML3P27482 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALML3P27482 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALML3P27482 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALML3P27482 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CALML3P27482 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CALML3P27482 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CALML3P27482 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALML3P27482 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALML3P27482 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CALML3P27482 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CALML3P27482 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CALML3P27482 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CALML3P27482 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CALML3P27482 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALML3P27482 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CALML3P27482 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CALML3P27482 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALML3P27482 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALML3P27482 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALML3P27482 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALML3P27482 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CALML3P27482 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CALML3P27482 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CALML3P27482 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CALML3P27482 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CALML3P27482 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALML3P27482 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CALML3P27482 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CALML3P27482 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CALML3P27482 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CALML3P27482 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CALML3P27482 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CALML3P27482 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALML3P27482 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALML3P27482 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALML3P27482 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALML3P27482 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CALML3P27482 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CALML3P27482 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CALML3P27482 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CALML3P27482 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CALML3P27482 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CALML3P27482 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALML3P27482 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CALML3P27482 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CALML3P27482 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CALML3P27482 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALML3P27482 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CALML3P27482 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CALML3P27482 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALML3P27482 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALML3P27482 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALML3P27482 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALML3P27482 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALML3P27482 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CALML3P27482 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALML3P27482 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALML3P27482 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALML3P27482 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALML3P27482 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALML3P27482 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CALML3P27482 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALML3P27482 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALML3P27482 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALML3P27482 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALML3P27482 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALML3P27482 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CALML3P27482 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALML3P27482 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALML3P27482 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALML3P27482 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALML3P27482 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALML3P27482 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CALML3P27482 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALML3P27482 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CALML3P27482 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALML3P27482 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALML3P27482 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALML3P27482 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALML3P27482 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CALML3P27482 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CALML3P27482 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CALML3P27482 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CALML3P27482 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CALML3P27482 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALML3P27482 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALML3P27482 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALML3P27482 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALML3P27482 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALML3P27482 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALML3P27482 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALML3P27482 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALML3P27482 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CALML3P27482 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALML3P27482 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALML3P27482 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALML3P27482 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALML3P27482 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms