Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VARSP26640 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VARSP26640 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VARSP26640 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VARSP26640 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VARSP26640 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VARSP26640 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VARSP26640 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VARSP26640 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VARSP26640 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VARSP26640 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VARSP26640 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VARSP26640 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VARSP26640 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VARSP26640 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VARSP26640 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VARSP26640 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VARSP26640 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VARSP26640 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VARSP26640 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VARSP26640 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VARSP26640 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VARSP26640 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VARSP26640 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VARSP26640 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VARSP26640 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VARSP26640 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VARSP26640 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VARSP26640 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VARSP26640 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VARSP26640 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VARSP26640 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VARSP26640 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VARSP26640 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VARSP26640 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VARSP26640 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VARSP26640 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VARSP26640 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VARSP26640 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VARSP26640 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VARSP26640 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VARSP26640 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VARSP26640 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VARSP26640 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VARSP26640 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VARSP26640 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VARSP26640 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VARSP26640 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VARSP26640 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VARSP26640 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VARSP26640 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VARSP26640 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VARSP26640 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VARSP26640 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VARSP26640 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VARSP26640 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VARSP26640 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VARSP26640 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VARSP26640 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VARSP26640 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VARSP26640 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VARSP26640 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VARSP26640 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VARSP26640 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VARSP26640 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VARSP26640 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VARSP26640 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VARSP26640 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VARSP26640 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VARSP26640 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VARSP26640 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VARSP26640 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VARSP26640 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VARSP26640 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VARSP26640 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VARSP26640 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VARSP26640 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VARSP26640 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VARSP26640 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VARSP26640 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VARSP26640 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VARSP26640 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VARSP26640 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VARSP26640 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VARSP26640 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VARSP26640 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VARSP26640 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VARSP26640 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VARSP26640 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VARSP26640 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VARSP26640 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VARSP26640 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VARSP26640 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VARSP26640 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VARSP26640 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VARSP26640 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VARSP26640 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VARSP26640 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VARSP26640 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VARSP26640 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms