Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMA1P25391 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LAMA1P25391 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LAMA1P25391 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms