Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3P25205 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3P25205 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3P25205 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3P25205 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3P25205 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3P25205 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3P25205 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3P25205 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3P25205 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3P25205 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM3P25205 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3P25205 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3P25205 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3P25205 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3P25205 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3P25205 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3P25205 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3P25205 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM3P25205 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM3P25205 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM3P25205 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM3P25205 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM3P25205 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM3P25205 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM3P25205 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM3P25205 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM3P25205 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM3P25205 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM3P25205 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM3P25205 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MCM3P25205 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM3P25205 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM3P25205 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM3P25205 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3P25205 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3P25205 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3P25205 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3P25205 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3P25205 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3P25205 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3P25205 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3P25205 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3P25205 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3P25205 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3P25205 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM3P25205 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM3P25205 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM3P25205 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM3P25205 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM3P25205 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM3P25205 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM3P25205 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MCM3P25205 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM3P25205 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM3P25205 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM3P25205 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM3P25205 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM3P25205 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM3P25205 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM3P25205 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM3P25205 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM3P25205 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM3P25205 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM3P25205 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM3P25205 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM3P25205 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM3P25205 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM3P25205 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM3P25205 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM3P25205 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM3P25205 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM3P25205 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM3P25205 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM3P25205 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM3P25205 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM3P25205 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM3P25205 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM3P25205 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM3P25205 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM3P25205 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM3P25205 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM3P25205 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM3P25205 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MCM3P25205 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM3P25205 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM3P25205 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM3P25205 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM3P25205 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM3P25205 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MCM3P25205 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM3P25205 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM3P25205 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM3P25205 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM3P25205 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM3P25205 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM3P25205 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM3P25205 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM3P25205 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MCM3P25205 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1202 ms