Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCNE1P24864 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCNE1P24864 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNE1P24864 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms