Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND1P24385 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND1P24385 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND1P24385 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND1P24385 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND1P24385 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND1P24385 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND1P24385 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND1P24385 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND1P24385 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND1P24385 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCND1P24385 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND1P24385 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND1P24385 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND1P24385 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND1P24385 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND1P24385 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCND1P24385 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND1P24385 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND1P24385 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND1P24385 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND1P24385 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND1P24385 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND1P24385 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND1P24385 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND1P24385 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCND1P24385 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND1P24385 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND1P24385 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND1P24385 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND1P24385 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCND1P24385 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND1P24385 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND1P24385 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND1P24385 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND1P24385 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND1P24385 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND1P24385 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND1P24385 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND1P24385 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND1P24385 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCND1P24385 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND1P24385 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND1P24385 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND1P24385 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND1P24385 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND1P24385 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND1P24385 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCND1P24385 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCND1P24385 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCND1P24385 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCND1P24385 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND1P24385 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND1P24385 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCND1P24385 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND1P24385 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND1P24385 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND1P24385 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND1P24385 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND1P24385 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND1P24385 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCND1P24385 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND1P24385 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND1P24385 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND1P24385 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND1P24385 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND1P24385 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND1P24385 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND1P24385 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND1P24385 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND1P24385 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND1P24385 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND1P24385 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCND1P24385 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND1P24385 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND1P24385 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND1P24385 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND1P24385 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND1P24385 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND1P24385 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND1P24385 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCND1P24385 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND1P24385 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND1P24385 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND1P24385 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND1P24385 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND1P24385 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND1P24385 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND1P24385 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND1P24385 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND1P24385 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND1P24385 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCND1P24385 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND1P24385 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND1P24385 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND1P24385 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND1P24385 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND1P24385 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND1P24385 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCND1P24385 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms