Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP100P23497 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP100P23497 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SP100P23497 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP100P23497 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP100P23497 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP100P23497 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SP100P23497 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP100P23497 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SP100P23497 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP100P23497 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SP100P23497 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP100P23497 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SP100P23497 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP100P23497 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP100P23497 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP100P23497 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SP100P23497 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP100P23497 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP100P23497 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SP100P23497 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP100P23497 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP100P23497 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP100P23497 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP100P23497 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP100P23497 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SP100P23497 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SP100P23497 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP100P23497 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP100P23497 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP100P23497 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP100P23497 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP100P23497 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP100P23497 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP100P23497 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP100P23497 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SP100P23497 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP100P23497 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP100P23497 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SP100P23497 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP100P23497 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP100P23497 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SP100P23497 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SP100P23497 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SP100P23497 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP100P23497 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP100P23497 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP100P23497 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP100P23497 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP100P23497 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP100P23497 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SP100P23497 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP100P23497 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP100P23497 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP100P23497 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SP100P23497 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP100P23497 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP100P23497 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP100P23497 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SP100P23497 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SP100P23497 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP100P23497 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP100P23497 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP100P23497 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP100P23497 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SP100P23497 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SP100P23497 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP100P23497 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP100P23497 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP100P23497 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP100P23497 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP100P23497 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP100P23497 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SP100P23497 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP100P23497 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SP100P23497 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP100P23497 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP100P23497 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SP100P23497 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP100P23497 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP100P23497 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP100P23497 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SP100P23497 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP100P23497 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP100P23497 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SP100P23497 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SP100P23497 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP100P23497 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP100P23497 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP100P23497 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP100P23497 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SP100P23497 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP100P23497 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SP100P23497 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP100P23497 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP100P23497 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP100P23497 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SP100P23497 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP100P23497 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP100P23497 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms