Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLDCP23378 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GLDCP23378 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLDCP23378 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLDCP23378 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLDCP23378 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLDCP23378 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLDCP23378 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLDCP23378 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLDCP23378 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLDCP23378 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLDCP23378 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLDCP23378 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLDCP23378 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLDCP23378 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLDCP23378 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GLDCP23378 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLDCP23378 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GLDCP23378 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLDCP23378 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLDCP23378 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GLDCP23378 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLDCP23378 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GLDCP23378 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLDCP23378 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GLDCP23378 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLDCP23378 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLDCP23378 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLDCP23378 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GLDCP23378 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLDCP23378 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLDCP23378 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLDCP23378 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLDCP23378 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLDCP23378 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLDCP23378 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLDCP23378 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLDCP23378 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLDCP23378 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLDCP23378 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLDCP23378 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLDCP23378 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLDCP23378 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLDCP23378 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLDCP23378 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLDCP23378 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLDCP23378 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLDCP23378 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLDCP23378 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLDCP23378 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLDCP23378 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLDCP23378 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLDCP23378 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLDCP23378 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLDCP23378 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLDCP23378 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLDCP23378 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLDCP23378 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLDCP23378 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLDCP23378 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLDCP23378 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLDCP23378 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLDCP23378 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLDCP23378 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLDCP23378 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLDCP23378 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLDCP23378 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLDCP23378 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GLDCP23378 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLDCP23378 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLDCP23378 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLDCP23378 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLDCP23378 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GLDCP23378 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLDCP23378 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GLDCP23378 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLDCP23378 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLDCP23378 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLDCP23378 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLDCP23378 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLDCP23378 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLDCP23378 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GLDCP23378 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLDCP23378 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GLDCP23378 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLDCP23378 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLDCP23378 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLDCP23378 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLDCP23378 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLDCP23378 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLDCP23378 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLDCP23378 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLDCP23378 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GLDCP23378 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLDCP23378 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLDCP23378 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLDCP23378 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLDCP23378 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLDCP23378 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GLDCP23378 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms