Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME2P23368 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME2P23368 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ME2P23368 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME2P23368 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME2P23368 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME2P23368 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME2P23368 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ME2P23368 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME2P23368 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME2P23368 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME2P23368 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME2P23368 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME2P23368 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ME2P23368 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ME2P23368 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME2P23368 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME2P23368 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME2P23368 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME2P23368 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME2P23368 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME2P23368 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME2P23368 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME2P23368 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME2P23368 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ME2P23368 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ME2P23368 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ME2P23368 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME2P23368 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME2P23368 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME2P23368 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME2P23368 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME2P23368 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME2P23368 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME2P23368 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME2P23368 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME2P23368 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ME2P23368 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME2P23368 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME2P23368 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME2P23368 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ME2P23368 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME2P23368 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME2P23368 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME2P23368 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME2P23368 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME2P23368 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ME2P23368 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME2P23368 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME2P23368 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME2P23368 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME2P23368 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME2P23368 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ME2P23368 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME2P23368 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME2P23368 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME2P23368 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ME2P23368 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME2P23368 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ME2P23368 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME2P23368 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME2P23368 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME2P23368 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME2P23368 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME2P23368 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME2P23368 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME2P23368 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME2P23368 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ME2P23368 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ME2P23368 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ME2P23368 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ME2P23368 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ME2P23368 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ME2P23368 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ME2P23368 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME2P23368 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME2P23368 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME2P23368 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ME2P23368 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME2P23368 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME2P23368 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME2P23368 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ME2P23368 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME2P23368 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME2P23368 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME2P23368 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ME2P23368 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME2P23368 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME2P23368 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME2P23368 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME2P23368 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ME2P23368 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME2P23368 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME2P23368 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME2P23368 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME2P23368 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ME2P23368 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME2P23368 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME2P23368 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ME2P23368 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms