Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
HRCP23327 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
HRCP23327 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
HRCP23327 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
HRCP23327 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
HRCP23327 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
HRCP23327 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HRCP23327 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HRCP23327 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HRCP23327 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HRCP23327 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HRCP23327 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HRCP23327 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HRCP23327 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HRCP23327 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
HRCP23327 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
HRCP23327 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
HRCP23327 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HRCP23327 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
HRCP23327 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
HRCP23327 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HRCP23327 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HRCP23327 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
HRCP23327 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
HRCP23327 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
HRCP23327 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
HRCP23327 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
HRCP23327 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
HRCP23327 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HRCP23327 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HRCP23327 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HRCP23327 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
HRCP23327 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
HRCP23327 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
HRCP23327 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
HRCP23327 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
HRCP23327 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
HRCP23327 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
HRCP23327 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
HRCP23327 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HRCP23327 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
HRCP23327 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
HRCP23327 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
HRCP23327 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
HRCP23327 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
HRCP23327 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
HRCP23327 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
HRCP23327 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HRCP23327 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HRCP23327 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
HRCP23327 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
HRCP23327 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HRCP23327 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HRCP23327 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
HRCP23327 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HRCP23327 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HRCP23327 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HRCP23327 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
HRCP23327 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HRCP23327 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HRCP23327 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
HRCP23327 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HRCP23327 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
HRCP23327 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HRCP23327 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HRCP23327 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
HRCP23327 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.46
HRCP23327 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
HRCP23327 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HRCP23327 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HRCP23327 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
HRCP23327 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
HRCP23327 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
HRCP23327 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
HRCP23327 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
HRCP23327 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
HRCP23327 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
HRCP23327 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
HRCP23327 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
HRCP23327 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HRCP23327 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HRCP23327 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HRCP23327 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HRCP23327 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HRCP23327 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HRCP23327 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
HRCP23327 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
HRCP23327 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HRCP23327 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HRCP23327 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HRCP23327 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
HRCP23327 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HRCP23327 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
HRCP23327 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HRCP23327 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HRCP23327 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HRCP23327 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HRCP23327 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
HRCP23327 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HRCP23327 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms