Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCMT1P22061 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PCMT1P22061 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCMT1P22061 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms