Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EFNA1P20827 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms