Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI1P19237 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNNI1P19237 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNNI1P19237 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms