Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ITGB6P18564 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGB6P18564 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGB6P18564 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms