Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FLT1P17948 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FLT1P17948 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FLT1P17948 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FLT1P17948 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FLT1P17948 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FLT1P17948 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FLT1P17948 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FLT1P17948 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FLT1P17948 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FLT1P17948 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FLT1P17948 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FLT1P17948 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FLT1P17948 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FLT1P17948 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FLT1P17948 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FLT1P17948 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FLT1P17948 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
FLT1P17948 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FLT1P17948 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FLT1P17948 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FLT1P17948 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FLT1P17948 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FLT1P17948 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FLT1P17948 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FLT1P17948 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FLT1P17948 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FLT1P17948 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FLT1P17948 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FLT1P17948 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FLT1P17948 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FLT1P17948 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FLT1P17948 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FLT1P17948 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FLT1P17948 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FLT1P17948 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FLT1P17948 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FLT1P17948 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FLT1P17948 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FLT1P17948 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLT1P17948 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLT1P17948 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLT1P17948 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
FLT1P17948 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLT1P17948 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLT1P17948 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FLT1P17948 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FLT1P17948 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FLT1P17948 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FLT1P17948 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FLT1P17948 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FLT1P17948 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FLT1P17948 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FLT1P17948 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT1P17948 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT1P17948 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FLT1P17948 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT1P17948 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT1P17948 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT1P17948 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FLT1P17948 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT1P17948 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT1P17948 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT1P17948 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT1P17948 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT1P17948 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT1P17948 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT1P17948 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FLT1P17948 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLT1P17948 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FLT1P17948 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLT1P17948 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLT1P17948 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLT1P17948 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FLT1P17948 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT1P17948 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT1P17948 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT1P17948 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT1P17948 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT1P17948 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT1P17948 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT1P17948 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT1P17948 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT1P17948 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FLT1P17948 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FLT1P17948 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms