Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GCFC2P16383 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCFC2P16383 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCFC2P16383 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms