Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDGFRAP16234 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDGFRAP16234 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDGFRAP16234 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms