Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSPP15924 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSPP15924 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSPP15924 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSPP15924 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSPP15924 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSPP15924 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSPP15924 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSPP15924 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSPP15924 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSPP15924 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSPP15924 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSPP15924 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSPP15924 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSPP15924 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DSPP15924 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSPP15924 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSPP15924 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSPP15924 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSPP15924 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSPP15924 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSPP15924 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSPP15924 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSPP15924 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSPP15924 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DSPP15924 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DSPP15924 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSPP15924 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DSPP15924 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSPP15924 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DSPP15924 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSPP15924 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSPP15924 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSPP15924 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSPP15924 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSPP15924 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSPP15924 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSPP15924 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSPP15924 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSPP15924 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSPP15924 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSPP15924 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSPP15924 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DSPP15924 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DSPP15924 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSPP15924 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSPP15924 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSPP15924 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSPP15924 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSPP15924 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DSPP15924 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSPP15924 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DSPP15924 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSPP15924 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DSPP15924 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSPP15924 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSPP15924 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSPP15924 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSPP15924 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSPP15924 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSPP15924 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DSPP15924 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSPP15924 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSPP15924 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSPP15924 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DSPP15924 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSPP15924 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSPP15924 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSPP15924 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DSPP15924 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSPP15924 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DSPP15924 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSPP15924 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSPP15924 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSPP15924 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DSPP15924 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DSPP15924 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSPP15924 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSPP15924 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSPP15924 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSPP15924 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSPP15924 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSPP15924 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSPP15924 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSPP15924 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSPP15924 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSPP15924 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSPP15924 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSPP15924 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSPP15924 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSPP15924 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSPP15924 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSPP15924 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSPP15924 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSPP15924 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSPP15924 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DSPP15924 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSPP15924 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSPP15924 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSPP15924 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms