Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MS4A1P11836 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MS4A1P11836 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MS4A1P11836 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MS4A1P11836 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
MS4A1P11836 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
MS4A1P11836 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
MS4A1P11836 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MS4A1P11836 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MS4A1P11836 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MS4A1P11836 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms