Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF1P10914 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRF1P10914 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF1P10914 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF1P10914 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF1P10914 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF1P10914 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF1P10914 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRF1P10914 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF1P10914 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF1P10914 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF1P10914 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
IRF1P10914 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF1P10914 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF1P10914 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF1P10914 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF1P10914 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
IRF1P10914 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF1P10914 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF1P10914 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF1P10914 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF1P10914 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF1P10914 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IRF1P10914 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF1P10914 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF1P10914 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF1P10914 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF1P10914 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF1P10914 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF1P10914 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF1P10914 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IRF1P10914 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF1P10914 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF1P10914 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF1P10914 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF1P10914 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF1P10914 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF1P10914 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IRF1P10914 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF1P10914 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF1P10914 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF1P10914 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF1P10914 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF1P10914 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IRF1P10914 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IRF1P10914 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF1P10914 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF1P10914 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF1P10914 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF1P10914 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF1P10914 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IRF1P10914 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF1P10914 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF1P10914 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF1P10914 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF1P10914 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IRF1P10914 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF1P10914 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF1P10914 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF1P10914 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF1P10914 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF1P10914 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF1P10914 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF1P10914 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF1P10914 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF1P10914 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF1P10914 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF1P10914 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF1P10914 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IRF1P10914 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF1P10914 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF1P10914 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF1P10914 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF1P10914 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF1P10914 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IRF1P10914 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF1P10914 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF1P10914 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF1P10914 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF1P10914 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF1P10914 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF1P10914 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF1P10914 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF1P10914 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF1P10914 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF1P10914 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IRF1P10914 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF1P10914 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF1P10914 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF1P10914 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IRF1P10914 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRF1P10914 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IRF1P10914 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF1P10914 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF1P10914 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF1P10914 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF1P10914 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF1P10914 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF1P10914 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF1P10914 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms