Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM225BP0DP42 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM225BP0DP42 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms