Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
C8orf88P0DMB2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
C8orf88P0DMB2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
C8orf88P0DMB2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms