Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC166P0CW27 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC166P0CW27 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC166P0CW27 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms