Protein–RNA interactions for Protein: P0CG20

PRR35, Proline-rich protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR35P0CG20 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRR35P0CG20 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR35P0CG20 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms