Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMBSP08397 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMBSP08397 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMBSP08397 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMBSP08397 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMBSP08397 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HMBSP08397 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMBSP08397 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMBSP08397 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMBSP08397 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMBSP08397 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMBSP08397 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMBSP08397 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMBSP08397 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMBSP08397 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMBSP08397 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMBSP08397 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMBSP08397 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMBSP08397 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMBSP08397 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMBSP08397 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMBSP08397 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMBSP08397 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMBSP08397 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMBSP08397 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMBSP08397 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMBSP08397 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMBSP08397 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMBSP08397 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HMBSP08397 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMBSP08397 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMBSP08397 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMBSP08397 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMBSP08397 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMBSP08397 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMBSP08397 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMBSP08397 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMBSP08397 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMBSP08397 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMBSP08397 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMBSP08397 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMBSP08397 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HMBSP08397 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HMBSP08397 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMBSP08397 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMBSP08397 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMBSP08397 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMBSP08397 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMBSP08397 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMBSP08397 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMBSP08397 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMBSP08397 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMBSP08397 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HMBSP08397 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMBSP08397 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMBSP08397 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMBSP08397 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMBSP08397 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMBSP08397 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMBSP08397 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMBSP08397 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMBSP08397 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMBSP08397 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMBSP08397 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMBSP08397 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMBSP08397 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HMBSP08397 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMBSP08397 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HMBSP08397 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMBSP08397 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMBSP08397 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMBSP08397 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMBSP08397 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMBSP08397 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HMBSP08397 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMBSP08397 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMBSP08397 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMBSP08397 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMBSP08397 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMBSP08397 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMBSP08397 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMBSP08397 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMBSP08397 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMBSP08397 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMBSP08397 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HMBSP08397 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMBSP08397 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMBSP08397 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMBSP08397 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMBSP08397 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMBSP08397 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMBSP08397 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMBSP08397 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMBSP08397 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMBSP08397 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMBSP08397 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMBSP08397 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMBSP08397 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMBSP08397 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMBSP08397 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms