Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI1P08151 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI1P08151 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI1P08151 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI1P08151 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI1P08151 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI1P08151 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GLI1P08151 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI1P08151 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GLI1P08151 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI1P08151 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI1P08151 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI1P08151 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI1P08151 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI1P08151 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI1P08151 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GLI1P08151 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI1P08151 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI1P08151 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI1P08151 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI1P08151 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GLI1P08151 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI1P08151 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI1P08151 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI1P08151 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GLI1P08151 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI1P08151 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI1P08151 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI1P08151 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI1P08151 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI1P08151 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI1P08151 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GLI1P08151 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI1P08151 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI1P08151 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI1P08151 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI1P08151 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI1P08151 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI1P08151 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI1P08151 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI1P08151 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI1P08151 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI1P08151 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI1P08151 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GLI1P08151 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI1P08151 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI1P08151 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI1P08151 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI1P08151 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI1P08151 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI1P08151 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI1P08151 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GLI1P08151 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI1P08151 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI1P08151 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI1P08151 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI1P08151 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI1P08151 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI1P08151 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI1P08151 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI1P08151 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GLI1P08151 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI1P08151 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI1P08151 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI1P08151 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI1P08151 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI1P08151 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GLI1P08151 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI1P08151 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI1P08151 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI1P08151 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GLI1P08151 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GLI1P08151 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GLI1P08151 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI1P08151 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI1P08151 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI1P08151 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI1P08151 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI1P08151 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI1P08151 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GLI1P08151 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI1P08151 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI1P08151 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI1P08151 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI1P08151 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI1P08151 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI1P08151 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI1P08151 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GLI1P08151 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI1P08151 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI1P08151 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI1P08151 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI1P08151 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI1P08151 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI1P08151 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI1P08151 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI1P08151 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI1P08151 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI1P08151 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GLI1P08151 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms