Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSF1RP07333 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSF1RP07333 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CSF1RP07333 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms