Protein–RNA interactions for Protein: P06731

CEACAM5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM5P06731 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEACAM5P06731 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEACAM5P06731 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CEACAM5P06731 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms