Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRKCGP05129 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCGP05129 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCGP05129 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms