Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PRM2P04554 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRM2P04554 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRM2P04554 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRM2P04554 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PRM2P04554 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRM2P04554 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRM2P04554 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRM2P04554 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRM2P04554 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRM2P04554 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PRM2P04554 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRM2P04554 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRM2P04554 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRM2P04554 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRM2P04554 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRM2P04554 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PRM2P04554 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRM2P04554 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRM2P04554 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRM2P04554 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRM2P04554 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PRM2P04554 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRM2P04554 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRM2P04554 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRM2P04554 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRM2P04554 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRM2P04554 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PRM2P04554 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRM2P04554 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRM2P04554 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PRM2P04554 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRM2P04554 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRM2P04554 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRM2P04554 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRM2P04554 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRM2P04554 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRM2P04554 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRM2P04554 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PRM2P04554 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRM2P04554 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
PRM2P04554 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRM2P04554 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRM2P04554 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRM2P04554 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRM2P04554 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRM2P04554 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRM2P04554 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRM2P04554 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRM2P04554 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRM2P04554 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRM2P04554 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRM2P04554 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRM2P04554 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRM2P04554 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRM2P04554 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRM2P04554 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRM2P04554 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRM2P04554 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRM2P04554 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRM2P04554 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRM2P04554 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRM2P04554 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRM2P04554 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRM2P04554 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRM2P04554 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRM2P04554 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRM2P04554 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRM2P04554 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRM2P04554 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRM2P04554 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRM2P04554 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRM2P04554 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRM2P04554 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRM2P04554 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRM2P04554 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRM2P04554 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRM2P04554 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRM2P04554 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRM2P04554 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PRM2P04554 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRM2P04554 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRM2P04554 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PRM2P04554 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRM2P04554 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms