Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERPINA1P01009 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINA1P01009 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms