Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PAK4O96013 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PAK4O96013 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAK4O96013 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAK4O96013 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAK4O96013 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PAK4O96013 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAK4O96013 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAK4O96013 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAK4O96013 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PAK4O96013 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAK4O96013 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAK4O96013 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAK4O96013 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PAK4O96013 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAK4O96013 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAK4O96013 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAK4O96013 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PAK4O96013 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAK4O96013 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PAK4O96013 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PAK4O96013 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAK4O96013 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAK4O96013 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAK4O96013 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PAK4O96013 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAK4O96013 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAK4O96013 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAK4O96013 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAK4O96013 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAK4O96013 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAK4O96013 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAK4O96013 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAK4O96013 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAK4O96013 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAK4O96013 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAK4O96013 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAK4O96013 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAK4O96013 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAK4O96013 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAK4O96013 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAK4O96013 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAK4O96013 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAK4O96013 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAK4O96013 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAK4O96013 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAK4O96013 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK4O96013 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK4O96013 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK4O96013 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK4O96013 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK4O96013 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK4O96013 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK4O96013 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK4O96013 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK4O96013 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK4O96013 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAK4O96013 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAK4O96013 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PAK4O96013 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAK4O96013 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAK4O96013 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAK4O96013 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAK4O96013 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAK4O96013 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAK4O96013 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAK4O96013 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAK4O96013 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAK4O96013 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAK4O96013 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAK4O96013 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAK4O96013 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAK4O96013 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAK4O96013 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAK4O96013 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAK4O96013 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAK4O96013 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAK4O96013 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAK4O96013 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PAK4O96013 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAK4O96013 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAK4O96013 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAK4O96013 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PAK4O96013 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAK4O96013 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAK4O96013 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAK4O96013 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAK4O96013 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAK4O96013 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAK4O96013 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PAK4O96013 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAK4O96013 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAK4O96013 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAK4O96013 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAK4O96013 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAK4O96013 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAK4O96013 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PAK4O96013 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAK4O96013 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAK4O96013 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms